El monitoreo se realiza en 65 puntos: 21 puntos en cursos de agua principales (arroyos Miguelete, Pantanoso, Las Piedras, Carrasco, Manga y Toledo, así como las cañadas Chacarita de Los Padres y de Las Canteras) y en 44 puntos en cursos de agua menores.
Se monitorean parámetros fisicoquímicos (pH, temperatura, conductividad, oxígeno disuelto, sólidos suspendidos totales, DBO, DQO, amonio, fósforo total, nitrógeno total, tensoactivos aniónicos, cromo total, plomo total) y parámetros microbiológicos (coliformes fecales).
Para brindar a la población información simplificada de algunos cuerpos de agua urbanos se crea, a partir de algunos parámetros monitoreados, un indicador integral, denominado Índice Simplificado de Calidad de Aguas (ISCA). Para su elaboración se tienen en cuenta la DBO, sólidos suspendidos totales, contenido de sales inorgánicas y temperatura. El ISCA establece un rango entre 0 y 100; cuanto mayor es el valor del índice, mejor es la calidad del agua.
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